9월 5일부터 6일 사이에 식중독이 발생한 5개 학교는 모두 같은 김치제조업체에서 생산한 김치(총각김치, 배추김치)를 납품받은 것으로 조사되었고, 현재 해당 김치에 대해서는 생산․판매 중단 및 회수조치 하였다.
 

또한 식중독이 발생한 9월 6일 중식 이후부터는 해당 김치를 섭취한 학교가 없어 추가 식중독 발생은 없는 것으로 확인 되었다.

9월 7일부터 10일 사이에 발생한 3개 학교 식중독은 문제가 된 김치로 인한 식중독인지 여부 등을 조사 진행 중에 있다.

최근 집중호우 등으로 인해 농산물을 식품 제조에 사용할 경우에는 사전에 충분히 세척해야 하나, 해당 김치제조업체의 경우 부원료로 사용한 농산물 일부가 충분히 세척되지 않은 상태에서 김치 제조에 사용되어 식중독균이 오염된 것으로 추정되고 있다.

식약청은 장기간의 호우로 농산물이 병원성 미생물에 오염되었을 개연성이 큰 만큼 충분한 세척 후에 제조에 사용할 것을 당부하며, 앞으로 식중독 원인 규명을 통해 유사사례 재발 방지에 힘쓸 계획이라고 밝혔다.

또한 전국 시·도 및 교육청에 학교급식 안전관리강화를 지시하고 매일 전국 학교 등 영양사에게 식중독 예방 문자메시지를 발송하는 한편, 전국 김치 제조업체의 식자재 세척과정 등에 대한 특별검증을 실시 중에 있다.