복지부에 따르면 신설된 복지행정지원관은 복지 전달체계를 총괄하는 업무를 맡는다. 이에 따라 기존 복지정책관 산하에 있던 지역복지과, 급여기준과, 복지정보과, 복지급여권리과를 복지행정지원관 산하로 편재하는 등 복지사업의 통합과 연계성 강화에 조직역량을 집중했다.

또한 의료분쟁조정, 건강보험 사후관리 및 질병관리본부 인체자원은행 지원 등 주요 정책현안의 원활한 수행을 위해 실무인력을 27명 보강했으며, 노후소득보장 업무의 시너지 효과를 위해 연금정책관의 소관을 사회복지정책실에서 저출산고령사회정책실로 변경하고 모자보건 업무를 건강쟁책국에서 저출산고령사회정책실로 이관했다.

질병관리본부는 장내세균과와 간염폴리오바이러스과를 수인성질환과로 통합했으며, 백신연구과를 신설해 각 과에 분산돼 있던 백신연구업무를 통합했다. 국립재활원은 기존 3과 1추진단, 1부(14과, 1센터)에서 3과 1부(15과) 1센터 1연구소(3과) 체제로 개편했다.

한편, 구강·가족건강과는 구강생활건강과로 저출산정책과는 출산정책과로 부서 명칭도 일부 변경됐다.